（东京），第2航空军（长春）；第5航空军；第6航空军（福冈）。
另外，日军大本营决定将台湾、朝鲜以及留在新不列颠岛、布干维尔、留在加罗林群岛和特鲁克岛上的部队，依次编成第10、第17、第8方面军，和原第31军，均归大本营直辖。
日本大本营在作了这些防御组织措施后，在本土的东海岸、南部海岸、西部海岸，强迫居民、学生，挖掘防御工事。此时的日本国内，昼夜遭受轰炸，男子被迫入伍，沿海各村构筑工事，军队调动和运输频繁，人民的情绪极为沮丧。
经过十多年的抗战，这场战争终于来到了发动侵略战争的日本本土。
日军在国内之防御部队此时共为72个师团，又35个旅团。单其中45个师团和24个旅团，是在1945年的年初仓促编成，训练时间很短，武器更是不足。
新编部队所装备的轻武器，步枪仅达50％，轻机枪77％，野、山炮25％，对战车炮26％。
而航空部队多为特攻用的旧式飞机与教练机，飞行员多数飞行在200小时，经验不足，技术不佳。
此外，日军一下子急速编成这么多部队，不仅兵器不足，各部队兵员也严重不足，不少师团仅有半数。
比如说九州、四国和箱根关以东沿海地区的作战工事，完成约60％至80％，其它地区的工事仅完成50％。九州、四国储备的弹药、油料等物资均按预定计划完成，但粮食储存量仅达到60％。箱根关以东地区，粮食储存量达到50％，但其它物资则极为不足。
还有就是，日军大本营根据硫磺岛作战和冲绳岛作战给美军造成重大损失的经验，决定在本土防御时，首先进行关键性的“水际作战”。
即当美军海上部队集结于近海地区和登陆换乘时，以大量的自杀空中特攻部队、岸防炮群、水上自杀机动
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